政府工程难结账的原因是多方面的，以下是一些主要原因：
政府的款项流动需要经过多个程序，如果地方财政没有足够的资金，会导致工程款项结账缓慢。
政府工程的款项结算涉及到多个部门和层级，流程复杂且耗时，导致结账进度缓慢。
分包商完成工作后，总包方需要时间进行计量和申报，这个过程可能会拖延数月，导致分包商难以在短期内收到应得的工程款项。
变更签证涉及多方利益，谈判过程复杂且耗时，往往导致款项结算延迟。
业主对总包的支付比例过低，导致总包方资金紧张，无法及时支付分包商款项。
结算过程中需要考虑复利和税收因素，这些都会增加结算的复杂性和难度。
合同中关于结算条款不明确或含糊，导致结算过程中出现纠纷，影响款项结算。
项目上缺乏具备工程结算、合同管理、造价等专业知识的人才，制约了结算工作的顺利进行。
各方对工程结算的理解存在局限，重视程度不够，导致结算过程拖延。
某些情况下，政府或企业可能出于自身利益考虑，恶意拖欠工程款。
疫情导致许多工程老板积累了大量历史欠账，同时增加了额外成本，资金周转困难。
建筑行业供求关系失衡，施工队竞争激烈，导致发包方在支付工程款时存在拖延现象。
综上所述，政府工程难结账的原因是多方面的，涉及财政、政务流程、合同管理、专业人才等多个层面。解决这一问题需要从多个角度入手，包括加强财政管理、简化政务流程、明确合同条款、培养专业人才等。