如果您的电动车因套牌被扣，可以按照以下步骤处理：
立即前往主管交管部门，并办理与被扣电动车相对应的合法有效凭证或相关证件，以证明该车确属您所有并符合上路标准。
向交管部门提交新办理的证件，并请求交管部门对您的电动车进行放行。在此过程中，请确保遵守相关法律法规，确保您的行为合法合规。
如果使用了其他车辆的机动车登记证书、号牌、行驶证、检验合格标志以及保险标志，根据《中华人民共和国道路交通安全法》第九十六条，交管部门有权对您的违法行为进行处罚，包括扣押车辆和处以罚款（二千元以上五千元以下）。
如果能够提供相应的合法证明文件，或者及时补办相关手续，交管部门将会尽快将您的电动车归还给您。
在领取车辆时，您需要携带相关证件，如身份证及其复印件、车辆出厂合格证、电动车购买发票信息等，并可能需要观看安全教育视频及回答问题。
如果套牌车逃逸无法查获，且原车主不能排除肇事车归其所有并套牌使用的情况下，事故损害赔偿责任由被套牌的原车主承担，但被套牌车主可以向套牌车主进行追偿。
请记住，处理此类问题时，务必保持冷静并遵守法律，以避免进一步的法律后果。