商铺过户应当在当地的房管局进行办理。具体流程包括：
买卖双方需携带本人的相关资料，包括申请表原件、身份证原件、房屋所有权证原件和复印件、土地使用权证复印件等。
根据房管局的要求，买卖双方需到相关税局部门交纳各种税费，并携带身份证原件和税费发票单据。
税费交纳完毕后，买卖双方携带身份证和交税费的发票单据，到房管局审察确认已完税，然后办理过户手续，领取过户回执。
买方根据过户回执中所指定的时间，携带身份证和过户回执到房管局领取二手商铺的新房产证。
建议在办理商铺过户时，提前准备好所有相关材料，并咨询当地房管局或相关机构以获取详细的办理流程和所需材料，以确保过户过程顺利进行。